In diesem Schritt werden der Mesh-Editor und das Registrierungswerkzeug als optionale Werkzeuge zu Verfügung gestellt. Wenn der Benutzer die Modelle registrieren oder die Modelle schneiden oder reparieren muss, kann diese Werkzeug links aus der Leiste aufgerufen werden. Erkennt die Anwendung dass die Modelle oder die Ausrichtung nicht den erwarteten Kriterien entsprechen, dann wird ein Hinweis hier gezeigt (z. B. eine Warnung)
Der Ablauf des Alignmentschrittes hängt von der Anzahl der geladenen Objekte (Oberkiefer, Unterkiefer, Vestibulär-Scan oder nur All-in-One-Scan) ab.